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为什么对于蛋白质结构的绘制这么慢？
因为只能做实验，一个一个观测，靠计算是没有办法算出来的。
一条几百个氨基酸组成的链子，每个氨基酸都要和周围所有氨基酸产生相互作用。
这里面的空间组合数，比全宇宙的原子总数还要多。
拿现有的超级计算机去硬算，算一个蛋白就得算上万年。
算不出来，就只能靠实验去肉眼看。
这就是传统的X射线晶体衍射和冷冻电镜技术。
科学家们得先把蛋白质提纯，再像熬冰糖一样，把它培养成完美无瑕的晶体。
然后拿X射线去照，或者冻起来拿电子显微镜去拍。
很多蛋白质娇气得很，死活不肯结晶。
特别是那些嵌在细胞膜上的跨膜蛋白，一离开细胞膜就散架。
往往一个顶尖大学的博士团队，耗费数年时间，烧掉几百万美元的科研经费。
每天在实验室里刷成千上万个试管，熬到头发掉光、延毕退学。
最后连一张清晰的衍射图都拿不到。
这就是著名的“蛋白质折叠问题”，一个悬在人类头顶整整五十年的终极科学难题。
全世界的生物学家，苦这玩意儿久矣。
大家辛辛苦苦四十年，全人类凑一块儿才攒了七万多个结构。
结果现在，一个不知道从哪个旮旯里冒出来的“S-Lab”。
一天之内，直接往桌子上甩了三万多个高精度结构！
这相当于把全球科学家过去四五年的工作量，一口气干完了！
这谁能信？
这就好比你是一个老实巴交的搬砖工人，每天累死累活搬一百块砖。
突然有个蒙面人跑过来跟你说，他昨天晚上一个人建起了一座万里长城。
你第一反应绝对不是跪下来拜师，而是摸摸这人的脑门，看他是不是发烧把脑子烧坏了。
于是，从哈佛、麻省理工、剑桥，再到国内的中科院、清华。
全球结构生物学界在经历了短暂的呆滞后，爆发出了铺天盖地的嘲讽与质疑。
下午两点，大洋彼岸的波士顿。
哈佛大学医学院的一间独立办公室里。
结构生物学界的知名大牛、CASP竞赛的常任评委霍华德教授，正端着一杯黑咖啡，对着电脑屏幕冷笑。
他的助教大卫站在办公桌对面，小心翼翼地看着自家老板的脸色。
“教授，CASP组委会的迈克尔博士刚刚发来邮件。
问我们要不要对S-Lab上传的这批数据进行立项评估？”大卫低声汇报道。
霍华德把咖啡杯往桌上一放，发出一声脆响。
“评估？评估什么？
评估一堆由随机数生成器搞出来的电子垃圾吗？”
霍华德嗤笑了一声，身体往椅背上一靠，满脸的不屑。
这就是学术圈大佬的傲慢。
在自己深耕了三十年的领域里。
任何超出他认知范围的东西，统统都是异端，统统都是骗局。
“可是教授，迈克尔博士说，他们初步抽检了几个文件的格式。
原子坐标的完整度非常高，不像乱码……”大卫试图解释两句。
“大卫，我的蠢学生，你跟着我读了四年博士。
难道连最基本的热力学定律都忘了吗？”霍华德毫不客气地打断了他。
大卫缩了缩脖子，不敢吱声了。
霍华德站起身，在办公室里踱了两步，开启了说教模式：
“以目前全人类的超级计算机算力。
哪怕把美国能源部的橡树岭超算中心全负荷开动。
靠物理分子动力学去硬算三万个复杂蛋白质的折叠，至少需要一万两千年！”
“这个S-Lab是什么东西？上帝的私人计算中心吗？”
“至于做实验？”霍华德把手一挥。
“全球所有实验室加起来，开足马力一年也就攒八千个结构，他一天就三万个。
难道S-Lab还养着十万个不要工资的博士后，没日没夜地替他摇试管、养晶体不成？”
其实霍华德心里比谁都清楚，传统的算法路线早就被证明走不通了。
不管是找相似序列照猫画虎的同源建模，还是凭经验把二级结构当积木拼凑。
亦或是穷举求能量最低，全都有着巨大的局限性。
全世界最聪明的脑袋瓜子凑在CASP比赛里玩了十几年。
预测出来的结构依旧是惨不忍睹，跟真实实验测出来的差了十万八千里。
现在有人告诉他，不用做实验，光靠算，一天算了三万个？
这不光是在侮辱他的智商，更是在动摇他赖以生存的学术根基！
要是计算机点点鼠标就能把结构算出来，那他手里那几台价值上千万美